Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc6D3YZP9 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms