Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms