Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms