Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp26c1B2RXA7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms