Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms