Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms