Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc8B2RUS7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms