Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms