Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed5B2RPU8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms