Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms