Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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