Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms