Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
SktA2AQ25 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SktA2AQ25 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SktA2AQ25 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SktA2AQ25 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SktA2AQ25 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SktA2AQ25 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms