Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms