Protein–RNA interactions for Protein: A2ALC6

Gm4985, MCG8129, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4985A2ALC6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm4985A2ALC6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm4985A2ALC6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm4985A2ALC6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm4985A2ALC6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm4985A2ALC6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm4985A2ALC6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm4985A2ALC6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm4985A2ALC6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4985A2ALC6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms