Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms