Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Lcn6A2AJB9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Lcn6A2AJB9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Lcn6A2AJB9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Lcn6A2AJB9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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