Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms