Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
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