Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer3W4VSP1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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