Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdfS4R2K0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms