Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms