Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn7Q9Z261 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn7Q9Z261 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.6 ms