Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cldn8Q9Z260 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms