Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
VarsQ9Z1Q9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VarsQ9Z1Q9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VarsQ9Z1Q9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms