Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr4Q9Z1L2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms