Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Nek4Q9Z1J2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nek4Q9Z1J2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nek4Q9Z1J2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms