Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG9

Msl3, Male-specific lethal 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3Q9WVG9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msl3Q9WVG9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Msl3Q9WVG9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msl3Q9WVG9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms