Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp1a4Q9WV27 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1a4Q9WV27 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms