Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd6ipQ9WU78 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdcd6ipQ9WU78 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcd6ipQ9WU78 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms