Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scnn1bQ9WU38 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scnn1bQ9WU38 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scnn1bQ9WU38 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scnn1bQ9WU38 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scnn1bQ9WU38 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scnn1bQ9WU38 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scnn1bQ9WU38 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scnn1bQ9WU38 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scnn1bQ9WU38 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scnn1bQ9WU38 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scnn1bQ9WU38 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scnn1bQ9WU38 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scnn1bQ9WU38 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scnn1bQ9WU38 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scnn1bQ9WU38 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scnn1bQ9WU38 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms