Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skp1Q9WTX5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skp1Q9WTX5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms