Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
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Usp18Q9WTV6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Usp18Q9WTV6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp18Q9WTV6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
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Usp18Q9WTV6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Usp18Q9WTV6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Usp18Q9WTV6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Usp18Q9WTV6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Usp18Q9WTV6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Usp18Q9WTV6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Usp18Q9WTV6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp18Q9WTV6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms