Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpv2Q9WTR1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpv2Q9WTR1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpv2Q9WTR1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 268 ms