Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vax2Q9WTP9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vax2Q9WTP9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms