Protein–RNA interactions for Protein: Q9R210

Tfeb, Transcription factor EB, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfebQ9R210 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TfebQ9R210 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TfebQ9R210 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms