Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trex2Q9R1A9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms