Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SrpxQ9R0M3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SrpxQ9R0M3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SrpxQ9R0M3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrpxQ9R0M3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrpxQ9R0M3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrpxQ9R0M3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 454.9 ms