Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pcm1Q9R0L6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcm1Q9R0L6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms