Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf4Q9QZS2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf4Q9QZS2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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