Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Npas3Q9QZQ0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms