Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Usp21Q9QZL6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Usp21Q9QZL6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp21Q9QZL6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms