Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc4Q9QZD4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ercc4Q9QZD4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms