Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd1Q9QY80 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hacd1Q9QY80 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms