Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd4Q9QY39 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Pdzd4Q9QY39 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms