Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcsk1nQ9QXV0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcsk1nQ9QXV0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms