Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnip3Q9QXT8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms