Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA1

Cyhr1, Cysteine and histidine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyhr1Q9QXA1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyhr1Q9QXA1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyhr1Q9QXA1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms