Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32,51■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32,51■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC32,5■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32,5■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC32,5■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32,49■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32,49■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,49■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32,47■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32,47■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,47■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC32,45■■■□□ 2,79
Cabp1Q9JLK7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,45■■■□□ 2,78
Cabp1Q9JLK7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Cabp1Q9JLK7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32,44■■■□□ 2,78
Cabp1Q9JLK7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Cabp1Q9JLK7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Cabp1Q9JLK7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Cabp1Q9JLK7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Cabp1Q9JLK7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Cabp1Q9JLK7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Cabp1Q9JLK7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC32,42■■■□□ 2,78
Cabp1Q9JLK7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC32,42■■■□□ 2,78
Cabp1Q9JLK7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Cabp1Q9JLK7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Cabp1Q9JLK7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32,41■■■□□ 2,78
Cabp1Q9JLK7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC32,41■■■□□ 2,78
Cabp1Q9JLK7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Cabp1Q9JLK7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Cabp1Q9JLK7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Cabp1Q9JLK7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Cabp1Q9JLK7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32,38■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32,36■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC32,36■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32,35■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32,34■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC32,34■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,77
Cabp1Q9JLK7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC32,31■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC32,31■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC32,31■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC32,3■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC32,3■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC32,28■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC32,28■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC32,28■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC32,28■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC32,27■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32,26■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,76
Cabp1Q9JLK7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,26■■■□□ 2,75
Cabp1Q9JLK7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Cabp1Q9JLK7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Cabp1Q9JLK7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Cabp1Q9JLK7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC32,25■■■□□ 2,75
Cabp1Q9JLK7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC32,25■■■□□ 2,75
Cabp1Q9JLK7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32,25■■■□□ 2,75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,5 ms