Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgm1Q9JLF6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Tgm1Q9JLF6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Tgm1Q9JLF6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tgm1Q9JLF6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms